形態上，酵母菌屬於真核生物，有卵形，橢圓型，不規則線性等，且細胞個體比細菌大得多。
細菌則屬於原核生物，細菌在結構上分爲如下三種球菌：按其排列方式又可分爲單球菌、雙球菌、四聯球菌、八疊球菌，葡萄球菌和鏈球菌。
桿菌：細胞形態較複雜，有短桿狀、棒桿狀、梭狀、月亮狀、分枝狀。
螺旋狀：可分爲弧菌（螺旋不滿一環）和螺菌（螺旋滿2~6環，小的堅硬的螺旋狀細菌）。此外，人們還發現星狀和方形細菌。
酵母菌屬於真核生物，有卵形，橢圓型，不規則線性等，且細胞個體比細菌大得多。
形態上酵母菌比細菌細胞大，酵母菌的菌落也比細菌大。
結構上酵母菌有細胞核屬真核，細菌沒有細胞核是原核。酵母菌和酵母細胞有什麼區別酵母菌是一類真菌，而酵母細胞是酵母菌的一個細胞的說法。
酵母菌是單細胞真菌，一個酵母菌就是由一個酵母細胞組成的，一個細胞能完成酵母菌的所有生命活動。所以酵母菌和酵母細胞是同一個概念。
