1）來源不同：酵母片是由釀造啤酒後的沉澱物加工而成。而天然營養酵母則是根據現代人的營養狀況及人體需要的營養結構特別培植的一種用於均衡營養補充的營養性酵母。
2）成份不同：普通酵母片不僅其酵母本身的營養結構和合理性與天然營養酵母有差異，而且其來源是釀造啤酒後的沉澱物，所以含有很多雜質成份，另外，普通酵母片在製成產品的過程中還可能添加了其它非天然成份，如成型劑、色素、香精等。而天然營養酵母除了爲調節鈣磷比例適當添加了天然碳酸鈣外，其它成份都是酵母本身具有的，不含色素、香精、防腐劑等任何人工合成成分。
3）吸收不同：天然營養酵母經過獨特超微破壁及自溶技術處理後，營養成份很容易被吸收利用，而普通酵母片、酵母粉是沒有破壁的，營養成份很難被充分吸收利用。
