直鏈澱粉和支鏈澱粉的區別在於結構、性質等不同。直鏈澱粉消化速度慢，部分不被前端小腸消化，可作爲益生元，提高了腸道有益菌數量，促進小腸內皮細胞發育及基因表達。
支鏈澱粉又稱膠原澱粉，分子相對較大，消化速度快、消化率高，難溶於水，供應葡萄糖快、時間短，對氨基酸的吸收有較大的影響。
1，直鏈澱粉經熬煮不易成糊冷卻後呈凝膠體，其大分子結構上，葡萄糖分子排列整齊。支鏈澱粉易成糊其粘性較大，但冷卻後不能呈凝膠體，結構上，葡萄糖分子排列不整齊。
2，直鏈澱粉遇碘-碘化鉀溶液顯藍色，支鏈澱粉則顯紫色。支連澱粉比支連澱粉有更大的粘性。直鏈澱溶解性比支鏈澱粉大，直鏈澱粉的單糖間透過а—1，4糖苷鍵連接，直鏈澱粉除а—1，4糖苷鍵連接外，還有а—1，6糖苷鍵連接。它們遇到澱粉顯現的顏色也有所不同。
3，澱粉有直鏈澱粉和支鏈澱粉兩類。直鏈澱粉含幾百個葡萄糖單元，支鏈澱粉含幾千個葡萄糖單元。在天然澱粉中直鏈的約佔22％～26％，它是可溶性的，其餘的則爲支鏈澱粉。當用碘溶液進行檢測時，直鏈澱粉液呈顯藍色，而支鏈澱粉與碘接觸時則變爲紅棕色。原因是：具有長螺旋段的直鏈澱粉可與長鏈的聚I3－形成複合物併產生藍色。直鏈澱粉－碘複合物含有19％的碘。支鏈澱粉與碘複合生成微紅－紫紅色，這是因爲支鏈澱粉的支鏈對於形成長鏈的聚I3－而言是太短了。
