生糞帶菌帶蟲，生羊糞中含有病菌、蟲卵和雜草種子，直接施用會帶來病、蟲害，還有害。所以只有發酵腐熟後才能給農作物作爲底肥施用。
肥效慢，這是農家肥的共同特點，雖然富含氮磷鉀等多種營養成份，但養分轉化發揮比較慢，所以主要用作改良土壤，提高土壤中的有機質含量，只能作底肥，並必須和化肥結合使用才能滿足農作物生長對養分的需求
羊糞加菌的好處和壞處
好處：羊糞經過腐熟是一種很好的糞肥，施入土壤不僅具有肥效好、抗病促長、培肥地力，還具有改良土壤，防止土壤板結，提質增產等特點，而且綜合成本不是太高，是果樹、蔬菜做底肥的好肥料。
壞處：羊糞中含有大腸菌、線蟲等病菌，如果直接使用會導致病蟲害的傳播、作物發病，而且
還會造成燒根燒苗現象等，因此，羊糞需要經過發酵處理纔會更安全。不僅是羊糞，名畜禽包括人糞中含有大的病菌、蟲卵和寄生蟲，未經發酵的糞肥是不可以直接施用在農作物上的！
