實際上，生蠔內臟腸和蝦內臟腸一樣有黑色腸腸，所以不建議大家食用。爲了獲得更好的口味，可以適當地將其移除。因爲生蠔的內臟中隱藏重金屬和其它污染物，而僅肉中的重金屬含量最低。生蠔一般是帶殼烹飪的，因此在清洗之前要先把外殼刷洗乾淨，由於生蠔的殼很鋒利，因此可以上膠皮手套用牙刷刷。用牙刷把殼全部刷乾淨。
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買回來的新鮮生蠔可以在水裏面滴上一些麻油，浸泡大概兩個小時到三個小時左右就能夠看到盆底裏面的很多髒東西，這些就是生蠔內臟裏面你的泥沙，這樣處理過的生蠔清洗起來也比較方便。
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吐盡泥沙的生蠔就可以開始清理內臟了，找到內外殼連接的縫隙，用刀把筋肉挑斷，打
找到內外殼連接的縫隙，用刀把筋肉挑斷，開啟生蠔厚重外殼了，去殼後的生蠔把裏面黑色的部位清理乾淨，牡蠣肉中黑的東西是牡蠣的內臟團，裏面應該會有少量糞便，清理乾淨的生蠔重洗乾淨後便可以用於烹飪美食。
