如果幹木耳發生了刺鼻的味道，那麼關鍵考慮到的是木耳置放的時間長時間，造成 了幹木耳具備了異味，那樣的幹木耳，如果長黴的狀況並不大，那麼能夠 將其放置自然光下晾乾，那樣異味便會降低還是能夠 常常服用的。
如果木耳發酸說明木耳已經腐敗變質了，這樣的木耳是不能吃的。
是沒有曬乾的時候，就發黴了，有可能陰雨天，下溼，導致這樣的問題，還有一個問題就是在沒采購的時候就開始腐爛，採摘的人員沒有發現，經過渾幹，或者曬太陽，都沒有發現，最後經過一系列的程序，裝包，密封，，還有就是放的時間過了有效期，最後才發現發黴
木耳如果有酸味，分兩種情況，一種是因爲木耳是菌類，菌類發酵會有點酸味，因此木耳聞着會有些酸，這屬於正常情況。另外一種情況，如果木耳是由於放置時間過長而產生酸味，則說明是由於變質所引起的，這種情況不要食用。
如果水發了之後吃不完，裝在有水的保鮮盒裏，放在冰箱冷藏室，亦可儲存兩三天。一次泡發後分別放在保鮮袋內紮緊袋口放入冰箱冷藏室的4℃溫度範圍保藏，隨吃隨取。
木耳受潮後，極易導致蟲害。因此，儲存前必須乾燥處理，使木耳含水量不超過12%，再裝入塑料袋或鋁罐中，密封后，置於襯有防潮紙的木箱或紙箱內。箱內可放入乾燥劑(幹木屑或生石灰等)。每隔10～15天檢查1次，若干燥劑已吸溼，應取出曬乾或烘乾後，再放入箱內，若木耳回潮，應及時取出乾製。如果木耳貯藏期間發現害蟲，應採取措施及時殺除。
