水通道蛋白的結構通式是控制水在細胞的進出。水通道蛋白（Aquaporin），又名水孔蛋白，是一種位於細胞膜上的蛋白質（內在膜蛋白），在細胞膜上組成“孔道”，可控制水在細胞的進出，就像是“細胞的幫浦”一樣。水通道是由約翰霍普金斯大學醫學院的美國科學家彼得·阿格雷所發現，他與透過X射線晶體學技術確認鉀離子通道結構的洛克斐勒大學霍華休斯醫學研究中心的羅德里克·麥金農共同榮獲了2003年諾貝爾化學獎。水分子經過Aquaporin時會形成單一縱列，進入彎曲狹窄的通道內，內部的偶極力與極性會幫助水分子旋轉，以適當角度穿越狹窄的通道，因此Aquaporin的蛋白構形爲僅能使水分子透過之原因。
