植物幼莖的頂端分生組織，經過細胞分裂，產生許多新細胞，其中在頂部的細胞仍舊保持頂端分生組織的特性，能夠繼續進行細胞分裂。在基部的細胞經過生長，漸漸分化爲3種組織系統：保護系統（表皮）、基本系統(皮層、髓部)、運輸系統或稱維管系統。
支援作用：莖支援着葉，使它們有規律地分佈，以利於充分接受陽光進行光合作用，同時也支援着花和果，以利於傳粉和種子的散佈。
輸導作用：根從土壤中吸收的水分和無機鹽透過莖輸送到地上各部分，同時莖也將葉製造的有機物傳輸到根和植物體的其他部分，供植物利用或貯藏。
貯藏作用：莖有貯藏營養物質的功能 ，在貯藏大量營養物質，並可成爲營養繁殖器官。
繁殖作用：多數植物的莖較易產生不定根和不定芽，或嫁接觀賞植物常見的營養繁殖方式。
植物的莖分爲地上莖和地下莖。地上莖又分爲：葉狀莖、卷鬚莖、肉質莖、莖刺。地下莖又分爲：根狀莖、塊莖、球莖、鱗莖。葉狀莖有：仙人掌、假葉樹等。卷鬚莖有：南瓜、黃瓜、葡萄等。肉質莖有：多肉等。莖刺有：山楂、皁角等。塊莖有：土豆等。根狀莖有：蓮藕、生薑等。球莖有：荸薺、慈菇等。鱗莖有：洋蔥、蒜頭等。
輸導作用：由根毛吸收的水分和無機鹽，沿莖主要自下而上輸導但有垂枝的植株中。
支援作用：莖靠內部所具有的發達的機械組織，承受着枝、葉、花、果的全部重量和壓力。
貯藏作用：莖中可以貯藏澱粉、糖類、脂肪、蛋白質以供植物體利用。
繁殖作用：利用莖、技進行扦插、壓條、嫁接，利用地下莖進行繁殖，已是植樹造林和農作物栽培中的一項重要措施。
