在溫度特別低的環境下，木耳菜的種子很難長出白芽。低溫影響了木耳菜出芽的速度，在後面的生長過程中，木耳菜會相繼出現較多的問題。木耳菜的生長過程中，要補充澆灑適量的水分。最好選擇疏鬆和排水性能良好的地塊栽植，在粘溼的地塊很容易出現積水，對木耳菜的根系生長沒有任何好處。在積水的地塊栽植木耳菜，會很容易導致幼苗出現腐爛死亡。
木耳菜種子厚，直接播種容易出現發芽慢，出芽遲緩，發芽不齊等問題，所以在種植木耳菜時應先浸種後催芽後再種植。
先將木耳菜的種子放到35度左右的溫水中浸泡24-48小時，這樣不僅可以加速發芽，還可以殺菌，將浸泡好的木耳菜種子撈出，放到溼潤的紗布袋中後放到25-30度的室溫下進行催芽，並每天早晚對木耳菜種子進行噴水，當木耳菜種子大部分已經開始露白後，便可以種植了。
