1、申請
申請人在廣東省政務服務網（）預申請後到視窗提交申請材料。
2、受理材料
前臺業務員對申請人的申請條件和申請材料進行審覈。申請人符合申請條件且報銷必備材料符合要求的，當場出具《深圳市社會醫療保險費用覈准業務收件回執》、《深圳市社會醫療保險費用覈准業務受理告知書》，申請人符合申請條件但報銷必備材料不符合要求的，前臺業務員告知申請人辦理業務所需材料，出具《深圳市社會醫療保險費用覈准業務指引告知書》申請人不符合申請條件的，受理部門出具《深圳市社會醫療保險費用覈准業務不予受理通知書》。
3、承辦
受理部門接收申請材料後，後臺業務員1個工作日內審覈報銷法定條件是否符合、時效是否正確，同時，還需確定是否需要提交補充材料，如需補充，應當2個工作日內發放《深圳市社會醫療保險費用覈准業務補正材料通知書》，一次告知申請人需要補正的全部內容，參保人需在收到補正材料通知後5個工作日內補齊材料，逾期不補正的，業務員按已有材料做出覈准或不予覈准決定不予覈准的情形，如申請人符合申請條件，可在備齊材料後於法定有效期內按規定重新提出申請。
4、審覈
業務員5個工作日內對報銷清單進行詳細審覈，確認無誤後將該業務發送給審批人。
5、審批
審批人2個工作日內進行審批，覈對相應資訊並確認無誤後，做出審批透過或不透過的決定。
6、辦結
審批完成後，即時辦結業務，系統自動將已辦結業務的相關資訊發送財務部門及視窗受理平臺。（審批後即時辦結，情況複雜或者特殊情況下，延期10個工作日。對涉嫌作假等特殊案件需進行真實性調查覈實，調查覈實工作需於60日內完成。進行調查覈實的案件，調查覈實所需時間獨立計算，不計入辦理時限。）
7、送達
工作人員收到業務辦結資訊後，予以覈准的，出具《深圳市社會醫療保險費用覈准決定書》和《深圳市社會醫療保險費用報銷單》，不予覈准的，出具《深圳市社會醫療保險費用不予覈准決定書》，文書根據參保人意願選擇郵寄送達或者視窗送達。
