蛋白質分子的一級結構是由共價鍵形成，而維持蛋白質的空間構象的穩定性的是次級鍵。次級鍵是非共價鍵，屬於次級鍵的有氫鍵，鹽鍵，疏水鍵或稱疏水力。
1、蛋白質的一級結構：蛋白質多肽鏈中氨基酸的排列順序，其主要連接鍵是肽鍵。2.蛋白質的二級結構：多肽鏈上的主鏈有規則的摺疊方式，包括α-螺旋，β-摺疊，β-轉角 ，無規則捲曲，Ω環等。靠氫鍵維持。3.蛋白質的三級結構：是在二級結構的基礎上進一步盤繞、摺疊形成。是蛋白質分子處於它的天然摺疊狀態的三維構象，其主要靠氨基酸側鏈之間的疏水作用力、氫鍵、範德華力和靜電作用來維持（非共價鍵）。4.蛋白質的四級結構：主要靠次級鍵（非共價鍵）維持。
