消毒方法如下：
一、食鹽浸泡消毒
當羊毛已經被剪下並收集好，但在這過程中羊場發生疫情，羊毛也被沾染了，就需要進行消毒。一般是用藥水混合，食鹽水和鹽酸溶液調製等量混在一起，並且要保持這個藥液一直在三十度的溫度，然後把羊皮毛泡進去。有一個很重要的，就是一定要泡足四十小時才能撈出瀝乾，然後再放進加了氫氧化鈉的溶液裏，洗一洗放太陽下曬乾，最後再放進消毒液泡兩天，再撈出洗淨曬乾，這纔算徹底給羊毛消毒，不能早早就完事，有病毒殘留會後患無窮的。
二、過氧乙酸消毒
這個方法適用於任何病畜的毛髮，不僅是羊毛，牛毛、雞毛什麼的都可以用這個方法。把皮毛放進過氧乙酸的調配溶液裏浸泡三十分鐘後撈出來，再用乾淨水沖洗乾淨晾乾就可以了。這個方法比較簡單且消耗的時間不長，適合傳染性不強烈的病羊羊毛消毒使用。
三、生石灰消毒
羊患有蟎蟲病後的皮毛，可以用這個方法來消毒。生石灰跟水混合做成熟石灰，再加水做成石灰乳狀，有蟎蟲病疫的羊皮要放進石灰乳裏浸泡12小時才能徹底殺死蟎蟲殘留，最後拿出來晾乾就好了。
如果羊曾患有口蹄疫，那羊毛也可以泡石灰乳中，跟上述方法養羊，只需泡兩個小時就可以了，石灰乳對口蹄疫病毒很有殺傷力，消毒時間會比較短。
四、食鹽醃製消毒
前面說過食鹽水消毒，但是調配藥水的程序較爲複雜，如果羊毛是沾有布氏桿菌，那用鹽醃一醃就好了，簡單易做。將食用鹽均勻塗在皮毛表面，存在特定位置，醃製兩個月差不多就可以了，如果是羔羊或者是羊胎的毛，醃製三個月差不多就能徹底消毒。
對患炭疽、口蹄疫、布氏桿菌病、羊痘、壞死桿菌病等的羊皮 羊毛均應消毒。應當注意，發生炭疽時，嚴禁從屍體上剝皮在儲 存的原料中即使只發現1張患炭疽病的羊皮，也應將整堆與它接觸 過的羊皮消毒。
