較常用的防病消毒藥物有兩種，第一種是食鹽，食鹽比較安全、有效，並且來源方便。每10公斤水加100-300克，即配成1-3%濃度的鹽水，消毒5-20分鐘左右，浸浴時間長短根據水溫高低而定，可殺滅大多數病菌和寄生蟲。
第二種是高錳酸鉀，可以直接加入魚缸中。用藥濃度是10公斤水用0.03克高錳酸鉀。0.03克重量高錳酸鉀的秤重不方便。因此，先秤1克高錳酸鉀充分溶解在1公斤水中，即配成千分之一濃度的藥液，儲存在可口可樂瓶中備用，再用吸管或針筒吸取30毫升高錳酸鉀藥液加入10公斤水中，用藥後24小時進行換水。不過需要注意，對於小型熱帶魚。高錳酸鉀的毒性較大，用藥後要注意觀察熱帶魚的活動狀態，一發現有異常，立刻進行搶救，即大量換水或將熱帶魚撈出。
