記賬憑證編號的方法有多種：
1、是將財會部門內的全部記賬憑證作爲一類統一編號，編爲記字第××號
2、分別按現金和銀行存款收入、現金和銀行存款付出以及轉賬業務三類進行編號，分別編爲收字第××號、付字第××號、轉字第××號
3、按現金收入、現金付出、銀行存款收入、銀行存款討出和轉賬五類進行編號，分別編爲現收字第××號、現付字第××號、銀收字第××號、銀付字第××號、轉字第××號。當月記賬憑證的編號，可以在填寫記賬憑證的當日填寫，也可以在月末或裝訂憑證時填寫。
記賬憑證無論是統一編號還是分類編號，均應分月份按自然數字順序連續編號。通常，一張記賬憑證編一個號，不得跳號、重號。
4、業務量大的單位，可使用"記賬憑證編號單"、按照本單位記賬憑證編號的方法，事先在編號單上印滿順序號、編號時用一個銷一個，由制證人註銷，在裝訂憑證時將編號單附上，使記賬憑證的編號和張數一目瞭然，方便查考。
