內涵不同：按照《辭海》的解釋，“體制”是指國家機關、企業和事業單位在機構設定、領導隸屬關係和管理權限劃分等方面的體系、制度、方法、形式等的總稱 “機制”原指機器的構造和運作原理，借指事物的內在工作方式，包括有關機構組成部分的相互關係以及各種變化的相互聯繫。
兩者的中心語和使用範圍不一樣，“體制”指的是有關組織形式的制度，限於上下之間有層級關係的國家、國家機關、企事業單位，例如經濟體制、政治體制、教育體制、體制改革等“機制”由有機體喻指一個工作系統的組織機構或部分之間相互作用的過程和方式，例如市場機制、競爭機制、用人機制等。
