酸強程度不同。檸檬酸爲可食用。鹽酸不可。有機無機的區別。應用領域不同 一水檸檬酸主要用於食品、飲料行業，作爲酸味劑、調味劑及防腐劑、保鮮劑。還在化工行業、化妝品行業及洗滌行業中用作抗氧化劑、增塑劑、洗滌劑。 而無水檸檬酸主要用於食品、飲料行業作爲酸味劑、酸度調節劑、調味劑及防腐劑、保鮮劑。
無水檸檬酸在國民經濟中有廣泛應用，許多工業部門都需要無水檸檬酸。使用無水檸檬酸最多的部門是化學藥品。
鹽酸強速度快易腐蝕，檸檬酸弱速度慢不易腐蝕而且綠色安全還有醋酸，鐵路部門用磷酸清洗電茶爐水垢，污染環境危害健康，沒人管
檸檬酸和鹽酸不會發生反應.因爲鹽酸不是氧化性酸，還原性也沒有.也不會發生取代、置換反應.不過可能會催化檸檬酸的酯化或者縮合反應.但這是催化，不是直接與檸檬酸反應.
