生態經濟學研究的特點是：
（1）綜合性。生態經濟學是以自然科學同社會科學相結合來研究經濟問題，從生態經濟系統的整體上研究社會經濟與自然生態之間的關係。
（2）層次性。從縱向來說，包括全社會生態經濟問題的研究，以及各專業類型生態經濟問題的研究，如農田生態經濟、森林生態經濟、草原生態經濟、水域生態經濟和城市生態經濟等。其下還可以再加劃分，如農田生態經濟，又包括水田生態經濟、旱田生態經濟，並可再按主要作物分別研究其生態經濟問題。從橫向來說，包括各種層次區域生態經濟問題的研究。
（3）地域性。生態經濟問題具有明顯的地域特殊性，生態經濟學研究要以一個國家或一個地區的國情或地區情況爲依據。
（4）戰略性。社會經濟發展，不僅要滿足人們的物質需求，而且要保護自然資源的再生能力不僅追求局部和近期的經濟效益，而且要保持全局和長遠的經濟效益，永久保持人類生存、發展的良好生態環境。生態經濟研究的目標是使生態經濟系統整體效益優化，從宏觀上爲社會經濟的發展指出方向，因此具有戰略意義
中國生態經濟學研究的特點包括生態經濟學是生態學與經濟學交叉發展起來的一門新興邊緣學科。生態經濟學的目的，是根據生態學和經濟學的原理，從生態規律和經濟規律的結合上來研究人類經濟活動與自然生態環境的關係。
它研究的主要問題有：探討人類社會經濟與地球生物圈的關係，包括人口過剩、糧食匱乏、能源短缺、自然資源耗竭和環境污染研究自然生態系統的維持能力與國民經濟的關係，爲制定符合生態經濟規律的社會經濟綜合發展戰略提供科學依據研究森林、草原、農業、水域和城市等各主要生態經濟系統的結構、功能和綜合效益問題研究基本經濟實體同生態環境的相互作用的問題。生態經濟學的形成和發展體現了當代自然科學和社會科學走向綜合統一科學體系的大趨勢。
