1、尼羅河全年徑流量較小。因爲尼羅河大部分地區流經熱帶沙漠氣候區，降水對於河水補給有限，同時蒸發量大，河流流量較小。
2、徑流量變化大。河流上游地區屬於熱帶稀樹草原氣候。上游地區處在溼季時，降水豐富，大量補給河流，產生洪峯，河流徑流量大。上游地區處在乾季時，降水量少，對河流補給減少，河流徑流量小。
3、河流含沙量大，無結冰期。河流流經熱帶沙漠和熱帶稀樹草原氣候區，植被覆蓋率較低，水土流失嚴重，河流含沙量大。同時，因爲河流流經地區屬於熱帶氣候，河流無結冰期。
尼羅河有定期氾濫的特點，在蘇丹北部通常5月即開始漲水，8月達到最高水位，以後水位逐漸下降，1至5月爲低水位。雖然洪水是有規律發生的，但是水量及漲潮的時間變化很大。產生這種現象的原因是青尼羅河和阿特巴拉河，這兩條河的水源來自埃塞俄比亞高原上的季節性暴雨。尼羅河的河水80%以上是由埃塞俄比亞高原提供的，其餘的水來自東非高原湖。洪水到來時，會淹沒兩岸農田，洪水退後，又會留下一層厚厚的淤泥，形成肥沃的土壤。
四五千年前，埃及人就知道了如何掌握洪水的規律和利用兩岸肥沃的土地。很久以來，尼羅河河谷一直是棉田連綿、稻花飄香。在撒哈拉沙漠和阿拉伯沙漠的左右夾持中，蜿蜒的尼羅河猶如一條綠色的走廓，充滿着無限的生機。
尼羅河的水文特徵：水量不是很大水位季節變化大，秋季徑流量最大，汛期爲6---9 月（定期氾濫）含沙量較大無冰期。
