廢水好氧生物處理的最佳溫度是33~35℃，最高不能超過38℃。因爲生化處理污水是依靠污水中的好氧生化細菌，細菌是由蛋白質構成的微生物，在較低的溫度下微生物活性降低，近乎冬眠狀態，繁殖速度慢，不利於污水處理。
當溫度高於35℃甚致38℃時，蛋白質活性降低，甚致導致細菌死亡，同樣失去處理污水的能力。
因此在33~35℃時，既可保持細菌活性，又能提高其世代更新的速度，是理想的溫度。
在生化法處理污水工藝中，不管是好氧菌還是厭氧菌，最活躍的溫度是在30℃——40℃。
但是，絕大多數的污水處理廠都達不到這個溫度，雖然達不到，但不證明細菌不能工作，只是活性下降，需要增加容量來解決。
