馬氏的來源主要有以下幾種。
一、出自嬴姓
由趙氏而來，戰國時期，趙國大將趙奢，以善於用兵著稱，因戰功卓著。趙惠文王將其封於馬服，稱"馬服君"，趙奢之子趙興以"馬"爲氏。漢武帝時期，其後代遷至右扶風茂陵<今陝西興平東北>。
二、由他姓改姓
如東漢大司徒馬宮，本姓馬矢，後改姓馬。五代司馬球，其後代改爲姓馬。司馬遷族人，改姓司姓或馬姓。
三、由他族改姓
（1）據《金史。列傳第六十二。忠義四》所載，馬慶祥，字瑞寧，本名習禮吉思。先世自西域入居臨洮狄道，以馬爲氏，後徒家淨州天山<今內蒙古四子王朝>。即拜鳳翔府路兵馬都總管判官。另據《元史。列傳第三十三》所載，馬祖常，字伯庸，世爲庸右部，居淨州天山，有錫裏吉思者，於祖常爲高祖，金季爲鳳翔兵判官，以節死贈恆州刺史。子孫因其官，以馬爲氏。
（2）伊斯蘭教創始人，穆罕默德曾被譯爲"馬哈麻"，"摩珂末""謨罕德"等，後信奉伊斯蘭教的一些少數民族便以"馬"爲姓<其他還有以"哈"，"麻"等爲姓的。
（2）其他如金朝女真人汪古民，元朝時蒙古合魯氏，清滿洲八族費莫氏，馬佳氏，均有改姓爲馬者，故東北馬姓中不少是滿族子弟。
