葉綠素a，b的吸收峯過程：葉綠體膜上的兩套光合作用系統：光合作用系統一和光合作用系統二，（光合作用系統一比光合作用系統二要原始，但電子傳遞先在光合系統二開始）在光照的情況下，分別吸收680nm和700nm波長的光子，作爲能量，將從水分子光解過程中得到電子不斷傳遞，（能傳遞電子得僅有少數特殊狀態下的葉綠素a)。
光反應中氫離子的跨膜運輸用於atp的合成，那麼是易化擴散還是主動轉運，可以看出，水分子中的氫元素全部轉到葡萄糖裏，因此你要問的另外兩個氫離子就是轉移到光合作用產生的有機物裏了，輔酶Ⅱ雖然只能結合兩個氫離子，但是可能還能攜帶氫離子參與碳反應（暗反應
