1、編制的主體不同，通常情況下，竣工結算由施工單位進行編制，當然特殊情況下也有施工單位委託有資質的第三方機構代爲編制。結算審覈實施的主體有：有審覈能力的建設單位，或者建設單位委託的第三方中介機構（常說的造價諮詢單位），還有政府財政投資評審中心。
2、計算依據略有不同，竣工結算編制依據：竣工圖紙，現場簽證，施工合同，招標檔案，投標檔案，施工組織設計，隱蔽驗收，施工記錄等技術資料。而結算審覈的依據除了竣工圖紙，現場簽證，施工合同，招標檔案，投標檔案，施工組織設計，隱蔽驗收，施工記錄等技術資料外，還包括施工單位編制的結算書。
竣工結算是建設項目在施工工期內由施工承包單位完成設計施工圖的所有內容後，根據施工合同、竣工圖紙、變更設計、工程簽證等技術經濟資料依據相關的計價檔案辦理的體現建築安裝（含設備）工程的全部費用，簡稱竣工結算，一般由承包單位編制。
結算審覈，就是由具有造價諮詢單位資質或有權對竣工結算進行審覈的單位或機構對竣工結算進行全面的審覈，並提交審覈結果報告由甲乙雙方簽字認可後作爲建設項目的實際造價。
