委託第三方公司檢測的流程如下：
首先和第三方籤合同，預付款，把環評、環評批覆及相關資料交給第三方公司。
第三方公司工程師或技術人員到項目現場踏勘，踏勘完畢會給建設單位出一份整改意見，主要針對項目現場設備設施和環評及批覆要求不符的問題，建設單位根據意見結合實際情況進行整改。
第三方工程師或技術人員現場踏勘確認建設單位整改完成，項目符合驗收標準後，檢測公司根據第三方公司編寫的監測方案到項目現場進行驗收監測。
第三方公司收到檢測公司出具的監測報告，完成竣工環境保護驗收報告。邀請專家到項目現場檢視，覈實項目現場情況與驗收報告內容是否相符，開評審會，專家完善驗收意見，會議決定驗收是否透過。
會議決定透過，驗收報告修改完善，將驗收報告文字（包含附圖附件）及驗收意見（專家簽字、建設單位蓋章）上傳公示不少於20個工作日，到“全國建設項目竣工環境保護驗收資訊平臺”註冊賬號、登記項目資訊。
然後有的地方生態環境局要求將驗收全套資料交一份存檔，各地要求不同。
最後，建設單位交付尾款，第三方公司將項目驗收所有資料交給建設單位。項目驗收完成。
