這是因爲光在大氣層中發生折射造成的。
大氣層是不均勻的，所以光線在穿過大氣層時（相當於經過了兩證不同介質），會發生折射。並且，大氣層是時刻變化的，那麼，折射光線也會時刻變化。這樣，來自星星的光線，經過折射後，折射光線一會能進入人眼，一會不能，人就一會看見了星星，一會又不能看見星星，人就覺得星星在閃爍。 不管是星星自己發光，還是反射的太陽光，要達到人眼，必須經過大氣層，一定會在大氣層中發生折射，是這個意思。
夜空中，我們能看到的星星大多是恆星，恆星相對於地球來說是看不到在動的，只所以感覺星星在不停的眨眼，像會似的。其實這星動是因爲星星的光線經過地球大氣層，再進入眼睛，而大氣層是流動的，大氣層的密度也是不一樣的，由於大氣密度不同，又在流動，星星光線在進入大氣中發生折射，大氣的變化又造成折射率、折射角度變化，看上去就象星星在不停的眨眼睛，好像會動似的。
