農村有房在城市買房不算二套房。個人名下的房產是以在當地的房管局是否備案的爲準，農村自建的宅基地房屋在房管局是沒有備案的，所以在房管局是可以開出無房證明的，在城市買房是屬於個人首套房的待遇。
農民的宅基地是受法律保護的，嚴格來說城裏人是不能到農村進行房產投資的。對幾套房等限購措施那是相對商品房等城市房產。
當然如果農村的房屋，如果在當地房管局有備案，在城市買房的話可能也會算二套。
當然要算的！否則就是違章建築。這個問題自我國成立以來，就由農村的初級人民公社統一規範了土地房屋的統計，劃歸了集體所有，屬於地上的“浮財”也既是歸人民公社集體所有，我國的第一部憲法做出了明確的界定。以後不斷的修改與補充，得到了充分完善。並且農村的宅基地也都是要頒發給你房屋產權證的。
現在農民要自籌自建房，那要向村及鄉鎮兩級部門備案，得到審批後纔可以建造房屋的。凡是私自建造那既是屬於違建，必須要被強行拆除的！
如果農村的房產沒有房屋產權證的算一套房，否則就算二套房。
《關於規範商業性個人住房貸款中第二套住房認定標準的通知》中確定了二套房認定標準：一、商業性個人住房貸款中居民家庭住房套數，應依據擬購房家庭(包括借款人、配偶及未成年子女，下同)成員名下實際擁有的成套住房數量進行認定。
二、應借款人的申請或授權，直轄市、計劃單列市、省會()城市及其他具備查詢條件的城市房地產主管部門應透過房屋登記資訊系統進行借款人家庭住房登記記錄查詢，並出具書面查詢結果。
如因當地暫不具備查詢條件而不能提供家庭住房登記查詢結果的，借款人應向貸款人提交家庭住房實有套數書面誠信保證。貸款人查實誠信保證不實的，應將其記作不良記錄。
三、有下列情形之一的，貸款人應對借款人執行第二套(及以上)差別化住房信貸政策：
(一)借款人申請利用貸款購買住房，如在擬購房所在地房屋登記資訊系統(含預售合同登記備案系統，下同)中其家庭已登記有一套(及以上)成套住房的
(二)借款人已利用貸款購買過一套(及以上)住房，又申請貸款購買住房的
(三)貸款人透過查詢徵信記錄、面測、面談(必要時居訪)等形式的盡責調查，確信借款人家庭已有一套(及以上)住房的。
四、對能提供1年以上當地納稅證明或社會保險繳納證明的非本地居民申請住房貸款的，貸款人按本通知第三條執行差別化住房信貸政策。
對不能提供1年以上當地納稅證明或社會保險繳納證明的非本地居民申請住房貸款的，貸款人按第二套(及以上)的差別化住房信貸政策執行商品住房價格過高、上漲過快、供應緊張的地區，商業銀行可根據風險狀況和地方政府有關政策規定，對其暫停發放住房貸款。
五、各地要把城市房屋登記資訊系統建設作爲落實國發〔2010〕10號檔案的一項重要工作抓緊抓好。數據不完備的城市，要進一步完善系統尚未建立房屋登記系統的城市，要加快建設。2010年年底前各設區城市要基本建立房屋登記資訊系統。
