1879年，一羣教堂的禮拜者創立了富勒姆足球俱樂部，1888年定名爲富勒姆。在1896年將主場確定爲Craven Cottage之前，他們沒有自己的主場，只能四處流浪。
1907年，富勒姆加入了英格蘭足球聯賽，直到40年後他們才第一次進入頂級聯賽，但隨後不久便降入了乙級。50年代到70年代，富勒姆隊在傳奇人物海尼斯的帶領下堅守住了頂級聯賽的席位，後來的傳奇人物如博比-摩爾、喬治-貝斯特鄧都曾在70年代在富勒姆隊效力。但底蘊的薄弱最終令球隊降級，在70年代後期，他們從頂級聯賽降級並跌入了深淵。
進入80年代和90年代後，新主席法耶德出手闊綽，球隊終於在2001年又升入了英超。上賽季，他們在蒂加納的帶領下苦苦保級，最終英超最年輕主帥科爾曼在接手後以第13名的成績保住了英超的席位。
上賽季富勒姆勢頭較爲強勁，他們擺脫了保級弱富勒姆足球俱樂部球員風采(18張)旅的形象，最終獲得了第九名的佳績，不過由於新賽季富勒姆賣出了西恩-戴維斯等骨幹球員，實力上受到了一定程度的削弱，因此要想超越上賽季的成就困難極大。
但本賽季隨着球隊引進的鄧普西，薩莫拉等球員的出色發揮，球隊殺入了首屆歐洲聯賽的決賽，這是球隊歷史上第一次進入歐洲賽事的決賽。在英超熱刺，曼城和維拉的強勢崛起的形勢下，富勒姆依舊憑藉出色的戰績保持在積分榜的上半區，甚至在主場將衛冕冠軍曼聯打的潰不成軍。相信在主帥霍奇森的帶領下富勒姆不會僅僅只是曇花一現。
在09-10賽季，富勒姆在歐洲足聯歐洲聯賽的比賽中，斬下衛冕冠軍頓涅茨克礦工，逆轉尤文圖斯，連克德甲兩強沃爾夫斯堡和漢堡，殺入決賽，可惜在決賽中被馬德里競技2比1加時絕殺，痛失俱樂部歷史上第一座歐戰冠軍。
2010夏天，教練霍奇森出走擔任利物浦隊的主教練，馬克休斯接任，帶領球隊征戰2010-2011賽季英超聯賽。
