檸檬扦插極易生根成活。扦插爲無性繁殖方式，與嫁接有相同的優點，可以保持原優良性狀，掛果率不遜於嫁接苗，但初始幾年內長勢不如嫁接苗，3年以上的苗則長勢均衡。
1．插條採集及處理。採集停止生長、已木質化的嫩枝作插條。嫩枝粗0.6～0.8釐米，長15釐米，用清水洗淨，放人清潔的黑色薄膜袋內促進生根。爲防病菌感染，可先用託布津或多菌靈等殺菌處理，再用清水洗淨後放入袋中。
2．促根處理。將插條的下端剪成斜面，上端剪平，並剪除針刺，捆成50～100枝一捆，用1000×10-6的吲哚乙酸或萘乙酸浸漬下端至3釐米處，24小時後即可扦插。春季扦插時，將插條放入沙箱，保持恆溫25～28℃，5～7天澆水1次，經20～25天，在愈傷組織已形成，但尚未長根前將其扦插於準備好的插牀內。
3．調配插牀基質。位於保護地內的插牀，其基質以用膨脹(3～10毫米粗)的蛭石效果最好也可用珍珠巖和沙作基質或砂質壤土與沙按1：2的比例混合泥炭蘚與沙按1：2或1：3的比例混合。插牀下邊可安設加溫設備，插牀上面可覆蓋拱形薄膜小棚，以利於保溫保溼。在夏季，應給插牀遮光，遮光率以40％效果較好。
4．精心扦插。插條的株行距爲3釐米×20釐米。插時將其放人插牀的淺溝內，使頂端只有一芽於基質外，莖部用基質壓緊，然後灌水。待基質下沉後，插條上端只有1芽留於牀面。在春季用老枝作露地扦插時，應用薄膜覆蓋於拱形支架上，以保溫保溼。
5．科學管理。要合理調節插牀的溫、溼度。當溫度達到30℃以上時，應通風散熱，並適時灌水，保持基質水分。如果在5～6月份扦插，插條可用生長調節劑處理。扦插20天后，可降低基質溼度。這樣，插條生根成活率可達95％以上。
