區別在於基因不同：純種的黃耳龜有斑點。雜交的沒有斑點。
黃耳龜的黃耳是有自己特色的，純種黃腹滑龜耳斑與頰斑同樣寬大，額斑在兩眼之間，成T字形，同樣比較粗。頭頂額斑、耳斑和頰斑顏色相同，都是明亮的黃色，腹甲除兩個喉盾各有一黑斑外沒有任何雜色。有的巴西龜也是腹甲金黃，這些都可以認爲是雜交基因導致
無斑點就不是黃耳龜。
正宗黃耳龜，眼睛後面長有眼斑，爲明黃色，且眼斑與耳斑，頰斑均不粘連，顏色均爲明黃色，如有粘連，橙色，紅色出現，爲國內與密西西比紅耳龜雜交品種。背甲橢圓形，棱突微弱，橄欖色至軍綠色，其上的花紋爲黃色的短紋和線條，眼睛顏色除瞳孔爲純黑色外，其餘部分均爲明黃色，其他狀態顏色可認定爲雜交品種。腹甲顏色爲純黃色，只有靠近頸部的兩塊盾甲存在兩個黑色斑點，其餘部分均無斑點，如有斑點，爲雜交品種。
