社保滯納金不能超過本金，否則是違規的。
據相關規定，長時間未繳納保險費，超過6個月後就會產生滯納金。養老保險費滯納金計算方法是：應繳費總額×欠費天數×2%。滯納金封頂的金額是本金的40﹪，最高不能超過8000元，超過了也按照8000元收取。
社保滯納金超過本金部分的，可以申請將超過部分退回。根據我國相關法律的規定，徵收部門收取滯納金的不得超過本金總額。社保徵收部門收取滯納金的標準通常是按照日萬分之三~萬分之五來計算收取滯納金的，或按照標準來計算，當滯納金金額達到本金時則不再徵收，對於多徵收的部分應當返還給被徵收人。
