越獄第二季主要講：七個逃出生天的一級重犯成爲全國警力追捕的對象並展開新一輪的亡命旅途，在逃亡過程中他們面臨着種種情況，於是故事接着發展。而且因爲林肯被陷害與一宗政府陰謀有關，所以從第二季一開始，邁克爾?斯科菲爾德兄弟倆着重進行調查，希望能揭開陰謀背後的黑暗真相。而成功逃離監獄的5名獄友分別在美國中部逃竄，其中會有重新被捕的，也會有死於逃竄途中的。
第二季的人物陣型相對第一季來說並沒有多大的變化。但是有關這方面最值得一提的是，一個新的人物將出現：Buck Mahone，是一位3、40 歲，四肢發達但頭腦絕不簡單的FBI特工。他負責追捕逃跑了的七個囚犯。他有與麥克十分相似的特質：冷峻的眼神，敏捷的思維。這一角色由威廉.菲齊納出演。威廉.菲齊納在美國廣播公司(ABC)去年推出的科幻電視劇《入侵》中扮演了一名神經質、似乎被外星人“綁架”過的地方警員。據報道，他也是擺足了大牌的架子，直到《越獄》第二季6月16日開拍的前一天才同意簽約出演聯邦幹探這一主要角色。
