水體變綠一般都是因爲水體富營養化嚴重，導致水體內的綠藻等藻類大量、迅速生長、繁殖，從而使水體變綠，後期隨着富營養化嚴重，可能導致水體內的魚蝦死亡。水體富營養化多半是在人類活動的影響下，生物所需的氮、磷等營養物質大量進入湖泊、河湖、海灣等緩流水體，引起藻類及其他浮游生物迅速繁殖，水體溶解氧量下降，水質惡化，魚類及其他生物大量死亡的現象。在自然條件下，湖泊也會從貧營養狀態過渡到富營養狀態，不過這種自然過程非常緩慢。而人爲排放含營養物質的工業廢水和生活污水所引起的水體富營養化則可以在短時間內出現。
如果是魚缸中的水變綠了，是因爲魚缸裏生出了大量的藻類，就是俗稱的綠苔。綠苔對魚沒傷害，但是卻消耗水中的氧氣，從而排出CO2，這會降低魚缸的溶氧率，增加二氧化碳。這就間接地對觀賞魚的生存造成了威脅。如果缸內的魚不多，不影響觀賞的情況下，可以適當在魚缸中加入氧氣，以保證魚類存活。
