沒有本質上的區別。
第一，基層醫療編制屬於事業編制，所以基層醫療編制和事業編制是沒有本質上的區別的。
第二，基層醫療單位主要是指基層的醫院，比如說鄉鎮醫院，社區醫院等等，如果你是這些醫院的正式職工，那麼你的身份是屬於事業編制，如果不是正式職工，那你可能是臨時聘用人員。
基層醫療編制和事業編制的區別
事業編制是對所有事業單位人事編制的統稱，它涵蓋了增進社會福利和改善生產條件的部門，可以滿足人民對文化、教育、衛生等方面的需求。基層醫療編制是對事業編制中的衛生事業編制的稱呼，它包括了鄉鎮衛生院及以下醫療單位的編制，只對看病就醫和基本公共衛生服務的需求負責。
