都好，但主攻方向不一樣。
生物技術主要研究現代生物學和生物技術的基本理論、基本知識和基本技能，包括分子生物學、微生物學、基因工程、發酵工程及細胞工程等方面，主要利用生物體的物質來改進產品、改良植物和動物、或爲特殊用途而培養微生物。
常見的克隆、基因重組技術、生物疫苗培育皆隸屬於此。
植物保護主要研究農業生物、農業生態、農業有害生物的發生發展規律及其綜合治理技術等方面的基本知識和技能，進行植物有害生物的鑑定、監測、控制、治理等。
例如：植物雜草的剷除，蝗蟲、疫病等農業災害的預防與治理，農產品農藥殘留的檢測分析等。
