主要原因是：在整個含水層或含水層的某些地段上，由於地下水的開採量長期地超過了補給量（即過量開採），逐漸消耗了儲存量，並在一定週期內得不到恢復的結果。
在判斷某一地區是否會出現區域性地下水位持續下降時，要特別注意它與降水補給週期性變化所引起的水位下降現象相區別。
地下水位下降的主要原因，就是工業用水、生活用水、農業用水的無節制開發利用，最近幾十年的用水量，已經把過去幾千年幾萬年自然界積累的水資源都消費掉了，所以有計劃的利用水資源，有節制的開發水資源，是我們可持續發展的必修課之一。
其次就是地表植被的破壞，大氣降水不能透過腐質層滲入地下，補充地下水，而是成爲地表徑流白白的流失，甚至造成洪水災害。
地下水水位下降原因主要是人爲因素和自然因素：
1、人爲因素。人類的過分開採利用，由於過量的開採和不合理的利用地下水，常常造成地下水位嚴重下降，形成大面積的地下水下降漏斗，在地下水用量集中的城市地區，還會引起地面發生沉降。
2、自然因素。地震造成地勢的擡高、地下河道的下沉等河流的改道氣候的變化等，例如長期的氣候乾旱，農業灌溉和工業用水量的不斷增加，造成地下水位普遍下降。
