主要區別大致有
一是涉事程度不同。
停職檢查是當事人涉及的問題嚴重程度較輕，未構成犯罪，暫時停止工作，自我寫出檢查內容上報主管部門。
停職調查是涉事問題重大，停止工作接受相關部門調查。
二是處理結果不同。
停職檢查後，當事人僅僅受到調離、降職及黨紀政紀處罰。
停職調查後，當事人一般受到黨紀政紀處罰外，還會受到刑事處罰。
停職檢查和停職調查都是由於工作中出現了一定問題而採取的一種措施，但還是有區別的。停職檢查基本上確了當事人有過錯，但是問題不很嚴重，要停止職務進行自我檢討。而停職調查是問題還沒確定嚴重性，組織進行調查階段，也就是問題沒定性。
