應天府和金陵都是“南京市”的古稱，兩者區別如下：
1、年代不同，應天府是南京在明朝中前期的稱呼，當時朱元璋定都於此，後永樂時期遷都後，成爲陪都而金陵的名字始自公元前333年，至南北朝時期，共計800餘年
2、轄地不同，應天府當時下轄八縣，佔據今天南京全境及溧陽、句容等地金陵只是當時南京的主城區，面積上比較，應天府比金陵大得多
金陵是一個省，這個省包括了南京，姑蘇，揚州等。不過應天府和石頭城這兩個稱呼還是指南京。也就是說，在書中提到的南京的別名中，只有金陵賦予了特別意義，南京、應天府、石頭城，這三個是一個地方，金陵擴大到省，直接指代了大半江蘇地區。
應天府和金陵在一定的時期內都指的是如今江蘇省的省會，六朝古都南京。
但是時間範疇上，金陵悠遠於應天府，北宋之前南京通稱金陵，北宋之後有過建康、集慶、江寧等一系列名稱。
但是在北宋時期，應天府指的是現在河南省商丘附近，是北宋四京城之一的南京，和金陵是完全沒有關係的。
到了明朝，現在南京才叫應天府。後永樂時期，明朝遷都順天府，應天府就變成了明朝的陪都，是當時世界上最大的城市。
