將程序好的高錳酸鉀放容器中，加水攪拌時期全部溶解，當整個容器中看不到高錳酸鉀的顆粒，水溶液的顏色深淺一致時，高錳酸鉀溶液就配置成功了，然後將其裝入玻璃瓶中備用。高錳酸鉀是一種強氧化性的物質，使用過程中一定要戴上手套。
高錳酸鉀需要兌溫水使用， 不容易發生反應。 高錳酸鉀能夠透過氧化菌體的活性基團起到殺滅各種細菌繁殖體、結核桿菌、真菌的作用也可以滅活乙型肝炎病毒和芽孢。
不同濃度的高錳酸鉀溶液有不同的作用：
1、深紫色溶液（約0.3%濃度）具有強烈的氧化性，殺菌能力較強。2、玫瑰紅色溶液（約0.01%濃度）可以殺菌，瓜果蔬菜被細菌污染後，用此濃度的溶液浸泡5分鐘即可殺菌，而不改變果菜的色澤和味道。在醫療上可用該濃度溶液浸洗粘膜部位，如痔瘡等。有防感染、止癢、止痛等效用。
3、紫紅色溶液（約0.05%濃度）有止癢、消炎和防感染擴散之用，可用於浸洗足癬。因爲高錳酸鉀水溶液容易變質，建議在臨時用前溫水配製，並立即使用。
一般在臨牀上建議患者高錳酸鉀應當用溫水進行稀釋
正確操作方法是用一克高錳酸鉀配五千毫升二十攝氏度到三十攝氏度溫開水，在配置同時要注意攪拌均勻，肉眼觀察爲粉紅色即可以使用，時間一定要達到五分鐘以上才能夠起到殺菌效果。
