現時由香港入境內地有3種途徑，分別是經深圳灣口岸入境深圳、經港珠澳大橋入境珠海，以及從香港國際機場搭乘客機前往內地各城市，3種方法同樣需要符合內地相關防疫要求，包括取得核酸檢測陰性證明、提前預約隔離酒店等。
（一）由香港經深圳灣口岸入境深圳
6月29日，廣東省新冠肺炎防控指揮辦疫情防控組發佈緊急通知，宣佈即時調整入境人員的隔離管理期限和方式。
1持有48小時內核酸檢測陰性報告並彩色打印（粵港認可的33家香港定點核酸檢測機構出具）。
2透過“健康驛站房間網上預約系統”提前預訂未來7日內（含當日）的健康驛站房間名額。預約房間成功後，申請人可獲取通關當日有效的房間預約確認單（又稱“綠碼”），並在口岸通關現場出示。
3透過《海關旅客指尖服務》小程序或《出入境申報網頁》進行“海關健康申報”，完成後可獲得24小時有效的“黑碼”。
4在香港離境前，在出入境管制站需要進行額外的免費快速核酸檢測，獲得陰性結果的旅客可繼續行程。
5填報“入境旅客軌跡卡”，獲得“藍碼”。
6入境內地後，需接受深圳當地防疫部門安排，進行“7天集中隔離醫學觀察+3天居家健康監測”隔離，在集中隔離醫學觀察的第1、2、3、5、7天和居家健康監測第3天各開展一次口咽拭子核酸檢測。居家健康監測期間落實健康監測、不外出、按要求完成核酸檢測等防控要求。
注：通關現場不能出示當日有效的預約確認單的入境旅客，將安排返回香港。如確因特殊情況無法辦理返港手續，將安排在現場依次候補當日剩餘未預約以及已預約但未使用的房間名額。
（二）由香港經港珠澳大橋入境珠海
1持有48小時內核酸檢測陰性報告並彩色打印（粵港認可的33家香港定點核酸檢測機構出具）。
2提前預購珠港澳大橋穿梭巴士車票。
3在香港離境前，在出入境管制站需要進行額外的免費快速核酸檢測，獲得陰性結果的旅客可繼續行程。
4進入珠海進行落地核酸檢測後，再由專車透過閉環管理轉送至隔離酒店進行集中隔離。根據珠海市新冠肺炎防控指揮辦發佈的最新消息，香港經港珠澳大橋公路口岸入境人員實行“7+3”健康管理。
