醫保卡餘額負數的處理方法如下帳戶餘額爲負數不需要轉移。只要你醫保當月沒有處於欠費狀態，醫保卡爲負數也是可以結算的，醫保卡在醫院只是作爲一個憑據，裏面有錢了可以扣裏面的錢，沒有的話就直接支付，可以不用醫保卡。
需要定點單位的工作人員進行手動上傳，才能使相關數據傳輸到中心數據庫，再進行個人帳戶的衝減。
因爲您還在交費，負數可由以後個人繳費的部分填補，您不必擔心。您需要做的只是正常繳費即可。
有部分參保職工的醫保帳戶餘額成爲了負數或者較之系統升級前有所減少，造成這種情況的主要原因是：原來的職工醫保卡有存儲功能，醫保個人帳戶繳費到賬後，參保職工首先需要將職工資訊系統中個人帳戶到賬金額充值到醫保卡後，再使用醫保卡刷卡購藥。
