空氣能熱水器有很多個清洗的方法，比如外部的清洗，噴頭的清洗和內膽的清洗，都能維持熱水器的使用效果。
1、外部清潔
外部經常用溼毛巾擦拭即可，但注意不能使用酸性鹼性等清洗劑去擦。另外熱水器管道外層清潔也是很重要，但必須確保天然氣管道總閥是關閉的。清潔時不能使用熱水，直接使用沾溼的抹布進行擦拭就可以了。
2、噴頭清洗
如果發現噴水不暢或者堵塞現象，可將噴頭卸下，用螺絲刀將噴頭蓋中間的螺絲擰下，取下組裝套蓋，用廢舊牙刷對內表面的雜物進行清理。
3、內膽清洗
爲保證電熱水器使用安全和內膽壽命，在長期不使用的情況下可透過安全閥將內膽的水放掉，清洗前必須切斷電源。清潔時關閉進水閥門，開啟出水閥門，取下排口蓋（此時可同時檢查鎂棒的消耗情況，以便及時更換）將水箱內的水放完，然後開啟進水閥反覆沖洗幾分鐘，直至排出淨水，將鎂棒重新安裝好後，蓋上排污口蓋即可。
