一、硅藻水
硅藻是水產養殖公認的優良藻類，多生長在礦物質（尤其是硅元素）含量較高、池水攪動劇烈、光照充足的池塘或水域。絕大多數硅藻水呈棕黃色或棕褐色或紅褐色，也有一些初生期的硅藻水呈現黃綠色。硅藻水多是表層偏清淡，中下層較濃稠，風浪大、水體攪動大或增氧攪水厲害時水色會在中午下午時漸漸變濃。
二、甲藻水
甲藻多數是海產，只有少數生活於淡水或半鹹水中。甲藻有極強的趨光性，喜歡較高的水溫，多生長於輕度富營養化的偏酸性水體。甲藻水顏色多樣，有紅色（薄甲藻呈血紅帶狀赤潮、角藻呈紅褐雲彩狀水華、夜光藻呈夜晚發光的粉紅色赤潮、多甲藻呈紅褐色）有黃褐色（多甲藻呈黃褐色、原甲藻呈黃褐色發光赤潮）有黃綠色（前溝藻）也有藍綠色（裸甲藻呈藍綠色雲彩狀水華、亞歷山大藻呈淡藍色發光赤潮）。
甲藻水與硅藻水的區別
甲藻屬於水體表面藻類，甲藻水是鐵鏽色。硅藻屬於底棲藻類，硅藻水顯茶褐色，有很高的透明度。硅藻水是所有水產養殖中最好的水，溶氧充足，水體自淨能力強。
