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因運動方式的不同可分爲4綱:
1).鞭毛蟲綱Mastigophora
用鞭毛運動,有鞭毛l~數條。如眼蟲Euglena viridis。
2).肉足蟲綱Sarcodina
用僞足運動,即體表無固定表膜,原生質可向各方突出,作爲運動和捕食的細胞器官。如變形蟲Amoeba Pr0teus。
3).孢子蟲綱Sporozoa
全部寄生,生活史中產生孢子。如瘧原蟲Plasm0dium。
4).纖毛蟲綱Ciliata
用纖毛運動,即體表有衆多纖毛。如草履蟲Paramecium caudatum。
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