原核細胞適合這個細胞區分而來出的包一般原核細胞它沒有成型的細胞核只有泥和作爲遺傳物質的基礎，而原核細胞中大約是有三個原始密碼字，所謂的起始密碼子就是在DNA的轉錄翻譯上。合成蛋白質的起始位置。值得注意的，無論是原核細胞還是真核細胞都通用一套密碼字，也就是61個反密碼子。
起始密碼子，信使RNA（mRNA）的開放閱讀框架區中，每3個相鄰的核苷酸爲一組，代表一種氨基酸，這種存在於mRNA開放閱讀框架區的三聯體形式的核苷酸序列稱爲密碼子（codon）。由A、U、C、G四種核苷酸可組成64個密碼子，其中有61個密碼子可編碼氨基酸。AUG既編碼甲硫氨酸，又作爲多肽鏈合成的起始信號，作爲起始信號的密碼子稱爲起始密碼子。
絕大多數生物的起始密碼子 （initiation codon）都是AUG，作爲多肽鏈合成的起始信號，同時編碼一種氨基酸，原核生物的起始密碼子AUG翻譯對應的是甲酰甲硫氨酸（fMet），真核生物的起始密碼子AUG翻譯對應的是甲硫氨酸（Met）。某些原核生物也以GUG和UUG爲起始密碼子。
中文名
起始密碼子
外文名
initiation codon
某原核生物
GUG、UUG
運作原理
AUG是起始密碼子，也就是說肽鏈起始於甲硫氨酸。這個氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密碼子結合到一個與甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密碼子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上．也就是說，甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG編碼．但是起始氨基酸的信號要比所有其他氨基酸的信號複雜得多。根據Stent的理論，存在兩種不同的可以接受甲硫氨酸的tRNA。只有其中一個甲硫氨酸在特異的甲酰化酶作用下轉變爲甲酰甲硫氨酸。其他普通的甲硫氨酸一tRNA把甲硫氨酸結合到延伸的多肽鏈之間，而且只對應於AUG密碼子。甲酰甲硫氨酸起始多肽鏈的合成也可以響應GUG（纈氨酸的密碼子)。當GUG出現在起始點時，編碼甲硫氨酸，而出現在中間位置時．它編碼纈氨酸。對應的tRNA上的反密碼子似乎對密碼子的第一個核苷酸是寬容的。而第二和第三個核苷酸是選擇性的。
原核生物的起始密碼子AUG翻譯對應的是甲酰甲硫氨酸。某些原核生物也以GUG和UUG爲起始密碼子。
原核生物和真核生物mrna存在以下區別：1，存在形式不同原核生物mRNA常以多順反子的形式存在真核生物mRNA一般以單順反子的形式存在。2，工作形式不同原核生物mRNA的轉錄與翻譯一般是偶聯的真核生物轉錄的mRNA前體則需經轉錄後加工，加工爲成熟的mRNA與蛋白質結合生成資訊體後纔開始工作。
