他們在城池快要撞到太陽前，用月光寶盒穿越到了唐朝，就是星爺做山賊的那個時代。 故事一開始說的是白骨精，蜘蛛精到五指山上找孫悟空，但因爲他還沒獲得三顆痣，所以這個大聖爺並沒有法力。
後來想救白骨精穿越回到了五百年前，紫霞仙子在他腳下蓋了章，重新獲得法力。
之後大戰牛魔王，在危機關頭以大聖的身份回到了五百年後，繼續開始取經之路。這個結局要從第一部《月光寶盒》說起，五百年前上天安排取經四人組去取經，但是大聖爺不想去，還想殺死唐僧欺師滅祖。
觀音出手要滅大聖，唐僧以大無畏的精神犧牲自我換取大聖五百年後的再生。故事一開始就是再生後的大聖用月光寶盒穿越到紫霞仙子面前拿回三顆痣，做回大聖的故事。
經過和牛魔王的大戰，唐僧改變了自己囉嗦的毛病，這個毛病是五百年前和牛魔王大戰的時候改的，所以豬八戒說“師傅說話一向簡單明瞭”。
在菩提洞中遇到菩提老祖的轉世，大聖兌現了之前的承諾，還他三刀（這三刀是大聖變身前連累他們被蜘蛛精砍的）。
出了菩提洞，曾經的蜘蛛精跟白骨精成了姐妹同嫁一夫，相互扶持努力掙錢給他們的相公考取了狀元（化解了五百年前他們水火不容的恩怨）。
最後就是大聖爺也了了自己心願，看到一個至尊寶一個紫霞在城牆上對峙。
大聖爺施法進入至尊寶的身體，爲自己，爲至尊寶做了一件心裏很想做但因爲面子問題而不敢做的事情，接受紫霞。大話西遊兩部戲裏的死對頭的恩怨在結尾都得到了和解。而取經四人組重新踏上了取經路。
