(1)接收精度高於原子鐘的外部高精度時間源輸出的定時資訊，根據定時資訊中包含的有效性標誌判斷當前接收的定時資訊是否可用，根據定時資訊中包含的精度因子資訊判斷當前接收的定時資訊是否滿足測量要求，如果定時資訊可用且滿足測量要求，則進入步驟(2)
(2)以當前接收的外部高精度時間源的定時資訊作爲參考資訊，原子鐘計時輸出的定時資訊作爲測量資訊，將測量資訊減去參考資訊，得到時差測量值
(3)當時差測量值爲正數時，提高原子鐘輸出頻率值當時差測量值爲負數時，降低原子鐘輸出頻率值然後進行阿倫方差計算，判斷原子鐘輸出頻率的穩定度是否滿足原子鐘穩定要求，當阿倫方差不大於設定閾值時，判定原子鐘進入穩定狀態，將進入穩定狀態的時間和調整值作爲穩定參數儲存，進入下一步，否則返回步驟(1)
(4)在設定的時間內等間隔的計算若干次時差測量值，並進行算術平均，得到時差測量均值，將時差測量均值和測量時刻作爲調整參數進行儲存
