科創50和創業板50區別是他們是來自不同交易所的成分指數。創業板50指數成分股來自於深圳創業板，科創板50的指數成分股來自於上海科創板。在樣本空間上，創業板50選取的是最近半年日均成交金額、行業覆蓋情況在整體板塊排名前50的股票組成投資樣本。
科創50則是從過去一年的日均成交額、日均總市值中進行綜合篩選出前50的股票作爲投資樣本。
科創50與創業板50的區別在於創業板的定位，它徹底貫徹了創新驅動發展戰略，適應了更多依靠創新、創新、創造的發展大勢所趨，主要服務於成長型創新創業型企業，支援傳統產業與新技術、新產業、新業態、新模式深度融合。
