清池消毒藥物：這類藥物撒入池底或池水中，可以起到祛除病原、割斷它傳染或侵襲的途徑，是預防魚病不可缺少的藥物。常用的有生石灰、漂白粉、茶枯等，以生石灰的藥用效果最好。
殺滅體外寄生蟲藥物：這類藥物可以殺滅魚體外寄生的鞭毛蟲、纖毛蟲、吸管蟲及魚鰠等。在魚病盛行時節之前，病原體開端繁衍生長時運用防病效果更好。常用的有硫酸銅、硫酸亞鐵、碘、敵百蟲、硝酸亞汞等。箇中硫酸銅與硫酸亞鐵配成的合劑更是魚病防治中常用藥物之一。
治腸道病藥物：這類藥物對惹起魚類腸道感染的致病菌有抑止和殺滅的作用，內服可治療爲害青、草魚的細菌性腸炎，外用也可以作爲體表殺菌劑防治赤皮病、爛鰓病等。常用的有磺胺噻唑、磺胺膚、呋喃西林、呋喃唑酮、大蒜等。
魚種浸洗藥物：這類藥物多在魚種轉塘分養時對魚體進行消毒，避免魚種把病原體帶入養魚的水池裏去。常用的有食鹽、孔雀石綠、高錳酸鉀、碳酸氫鈉等。
抗菌素藥物：這類藥物對一些由致病菌惹起的魚病如白皮病、癤瘡病等有治療效果。常用的有青黴素、紅黴素、金黴素、慶豐黴素等。
