南通大學鍾秀校區有教育科學學院，地理科學學院，體育科學學院，藝術學院以及杏林學院。
南通大學設有20個學院、1個獨立學院（杏林學院）、1家直屬大型綜合三級甲等醫院（南通大學附屬醫院）和國際教育學院、繼續教育學院。
擁有基礎醫學、臨牀醫學2個博士後流動站，基礎醫學、臨牀醫學、資訊與通信工程3個一級學科博士點，22個一級學科碩士點，10個碩士專業學位點。
學校設有106個本科專業（2019年招生專業80個），涵蓋文學、理學、工學、醫學、藝術學、經濟學、法學、教育學、歷史學、管理學等10個學科門類。
擴展資料：
教育科學學院專業：小學教育（師範），學前教育（師範），教育技術學，教育技術學。
地理科學學院專業：地理科學(師範）、地理資訊科學、自然地理與資源環境、環境科學、人文地理與城鄉規劃、旅遊管理六個本科專業和和土地資源管理、學科教學(地理)、市政工程等。
體育科學學院專業：體育教育、社會體育指導與管理，體育學。
藝術學院專業：美術學（師範類）、美術學、視覺傳達設計、產品設計、工業設計、環境設計、動畫、建築學、音樂學、音樂表演等。
杏林學院專業：漢語言文學，英語，日語，環境設計，輕化工程，紡織工程，醫學實驗工程，工程管理，機械工程，土木工程等
