宗旨不同。申根籤是爲了取消國與國之間的邊界管制，而歐盟的好處就比較多，加入後所有國家的關稅就會取消，人員可以自由流動等等，所以兩者從根本上就有很大不同。
優勢不同
申根國的目的是爲了取消國與國之間邊境管制。持有任何成員國有效身份的可以在所有成員國境內自由流動，旅遊的朋友如果持有其中一國簽證，合法到所有申根國參觀。有點像我們省和省之間的流動。
歐盟的好處就更多了，加入歐盟後，歐盟所有國家之間都沒有了關稅，比如德國汽車出口到法國，不需要繳納任何關稅，也因此，歐盟對內沒有關稅，但對外關稅是一致的，也就是中國產品出口到法國和出口到拉脫維亞需要繳納的關稅是一樣的。
人員流動條件不同
歐盟內部人員也可以自由流動，比如匈牙利人可以自由的到英國工作，不需要工作簽證，還可以享受英國福利，所以英國想要退歐。注意，這裏人員自由流動，是指護照持有人，持匈牙利護照可以自由去英國工作，但持有匈牙利簽證是不可以的。
這裏就是申根的原因了，愛爾蘭是歐盟成員國但不是申根國家，所以你有德國護照可以自由去愛爾蘭，但你持有德國簽證不能自由去愛爾蘭，還得需要英國簽證，但你持有德國簽證可以自由去法國，因爲法國是申根國。
在申根國家坐火車飛機，就跟中國省份之間坐火車飛機一樣，沒有人檢查簽證，也就是沒有海關。但中國人去日本就需要經過日本海關，檢查簽證
1、概念不同。歐盟國是指一個經濟共同體，貨幣除了歐元區外，歐盟其它成員將會繼續使用本國的貨幣，比如英國和丹麥而申根國是指邊境協議，申根國家之間取消邊境管制。
2、成員不同。歐盟共有28個成員國，法國、德國、意大利、荷蘭、比利時、盧森堡爲創始成員國，於1951年結盟。此後，丹麥、愛爾蘭、英國（包括直布羅陀）（1973年），希臘（1981年），西班牙和葡萄牙（1986年），奧地利、芬蘭、瑞典（1995年）先後成爲歐盟成員國。
2004年5月1日，歐盟實現了有史以來規模最大的擴盟，波蘭、捷克、匈牙利、斯洛伐克、斯洛文尼亞、塞浦路斯、馬耳他、拉脫維亞、立陶宛和愛沙尼亞十個國家同時加入歐盟。2007年1月1日，保加利亞和羅馬尼亞加入歐盟。2013年7月1日，克羅地亞入盟。
此外，歐盟還啓動了與冰島的入盟談判將土耳其、馬其頓、黑山、阿爾巴尼亞、塞爾維亞列爲歐盟候選國。
申根國家有奧地利、比利時、丹麥、芬蘭、法國、德國、冰島、意大利、希臘、盧森堡、荷蘭、挪威、葡萄牙、西班牙、瑞典、匈牙利、捷克、斯洛伐克、斯洛文尼亞、波蘭、愛沙尼亞、拉脫維亞、立陶宛、馬耳他、瑞士和列支敦士登。
3、成立原因不同。歐盟成立原因：謀求統一是歐洲政治家長期的願望。歐洲的國家有共同的地域，語言上有相通性，而且有共同的文化傳統和價值觀。兩極格局。歐洲和蘇聯格格不入，同時又受到美國的控制，爲了擺脫這種局面，各國走向聯合。
西歐各國普遍較小，爲了適應第三次科技革命的需要，各國須擴大市場，打破阻礙經濟發展的桎梏，才能進一步促進歐洲經濟發展。
申根國成立原因：取消相互之間的邊境檢查點，並協調對申根區之外邊境控制。就是在成員國家之間取消邊境管制，持有任意成員國有效身份證或簽證人可以在所有成員國境內自由流動。根據該協定，旅遊者如果持有其中一國的有效簽證即可合法地到所有其他申根國家參觀。
