1、科屬不同
金線蓮，又名金線蘭，爲蘭科開脣蘭屬植物。
石斛，又名林蘭、禁生、杜蘭、金釵花等，爲天門冬目蘭科石斛屬植物。
2、形態特徵不同
金線蓮，呈皺縮捲曲，不規則狀的乾燥全草，根莖圓柱形，多彎曲，表面棕褐色，莖節明顯，有金黃色網狀脈，多捲縮而完整，展開爲寬卵形，表面黑棕色、下面暗紅色，部分葉脈紫紅色，葉柄基部鞘狀抱莖，偶見總狀花序頂生，花暗棕色，少見蒴果矩圓形，香氣特異，味淡。其雄株於雌株略有差別，主要在於雌株的葉脈更爲深，而雄株幾乎見不到葉脈。
石斛莖有點，像是一根棍子，屬於假球莖。莖具有根莖、直立、匍伏或具假球莖等生育形式。葉片從一片到多片皆有。花亮麗，花瓣通常較窄，脣瓣完整或三裂，與蕊柱基部相連。
